北京市延慶區(qū)醫(yī)院前身是1945年建立的延慶縣醫(yī)藥合作社,，地址在延慶鎮(zhèn)東岳廟內(nèi),。

1950年搬遷至延慶鎮(zhèn)東街路北耶穌教堂內(nèi)，更名延慶縣衛(wèi)生所,，是延慶第一所公立全民所有制醫(yī)療機(jī)構(gòu),。

1953年，更名延慶縣衛(wèi)生院,。

1956年,，正式成立延慶縣醫(yī)院，有職工36人,，綜合病床20張,。建立化驗(yàn)室、手術(shù)室,。設(shè)有內(nèi)兒科病房,、外婦科病房和兒科,、婦產(chǎn)科門診。

1956年舊址

1964年舊址

1965年，在延慶鎮(zhèn)東順城街路西新建醫(yī)院,。

1965年建內(nèi)兒科病房

1966年“文化大革命”運(yùn)動(dòng)開始,，延慶縣醫(yī)院更名為延慶縣人民衛(wèi)生院,，成立革命委員會(huì)，實(shí)行連部,、排,、班軍事化管理。

1966年醫(yī)院門診

1970年恢復(fù)延慶縣醫(yī)院。

1971年,，建戰(zhàn)備醫(yī)院,，面積872平方米，位于現(xiàn)北京急救中心延慶分中心大樓處,。

1971年建辦公樓

1973年,，恢復(fù)以科室為單位的管理模式,。

1978年，撤銷革命委員會(huì),，實(shí)行院長負(fù)責(zé)制,。自此，醫(yī)院進(jìn)入正規(guī)發(fā)展軌道,。

1980年，職工宿舍建成,，建筑面積2000平方米,。

1983年，醫(yī)院東側(cè)臨街建起急診樓,，設(shè)搶救室和觀察室,。

1983年建急診樓

1987年,，新建病房樓投入使用,，建筑面積6680平方米,病床增加到300張。

1986年落成的病房樓

1995年，通過北京市愛嬰醫(yī)院評估團(tuán)評估驗(yàn)收,，成為延慶縣首家“愛嬰醫(yī)院”,。

1996年，通過北京市二級甲等醫(yī)院評審團(tuán)評審,，成為延慶縣首家二級甲等醫(yī)院,。

1997年，新建門診樓投入使用,，建筑面積4607平方米,，重新規(guī)劃醫(yī)院門診科室設(shè)置。

1996年落成的門診樓

1999年，新建綜合住院樓竣工投入使用,，建筑面積3722平方米,，床位數(shù)增加到400張。

1999年落成的綜合病房樓

2005年，北京急救中心延慶分中心大樓竣工投入使用,，建筑面積12467平方米,。至此，醫(yī)院開放總床位達(dá)到540張,。

2005年啟用的急救中心大樓

2007年,，門急診樓改擴(kuò)建后投入使用,，日接診能力1500—2000人次。

2007年改擴(kuò)建后的門診樓

2015年9月，延慶縣人民政府與北京大學(xué)第三醫(yī)院簽訂深度合作框架協(xié)議,。同年12月,，延慶“撤縣設(shè)區(qū)”，延慶縣醫(yī)院正式更名為北京市延慶區(qū)醫(yī)院,，增名：北京大學(xué)第三醫(yī)院延慶醫(yī)院,。

2016年新建科研教學(xué)樓,、綜合住院樓投入使用，建筑面積29606平方米,，至此醫(yī)院床位達(dá)到700張,。同年2月，北京大學(xué)第三醫(yī)院延慶醫(yī)院正式掛牌,。 

2015年落成新病房樓

 (院慶籌備組)